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張文宏被舉報(bào)的博士論文究竟研究了些什么

來(lái)源:鳳凰網(wǎng)

張文宏的博士論文,研究的是結(jié)核桿菌最常見(jiàn)的兩種變異是否會(huì)導(dǎo)致耐藥嗎?

研究結(jié)果顯示,結(jié)核桿菌關(guān)鍵基因?qū)е碌牡鞍鬃儺愔校绻?15個(gè)位置發(fā)生了突變,那么耐藥會(huì)發(fā)生;如果第463個(gè)位置發(fā)生突變,很大可能不會(huì)導(dǎo)致耐藥。

被舉報(bào)存在高相似度的部分是論文的綜述,有研究人員表示,博士論文并不是都要發(fā)綜述,這部分可有可無(wú)。

震驚地得知當(dāng)張文宏醫(yī)生與“學(xué)術(shù)不端”一詞發(fā)生了聯(lián)系,學(xué)界內(nèi)外都頗為震驚。

作為一名科技記者,第一反應(yīng)是要看到張文宏的博士論文。

在萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)花了30元下載到論文全文,憑借粗淺的分子生物學(xué)背景和多年科技記者的學(xué)習(xí)判斷能力,試圖科普一下這篇《結(jié)核分支桿菌katG基因突變與其耐異肼機(jī)制的系列研究》(看標(biāo)題完全GET不到重點(diǎn)的研究)究竟做了什么工作。

回答這幾個(gè)問(wèn)題:從哪里來(lái)?到哪里去?究竟有沒(méi)有用?

(1)研究對(duì)象是什么?從哪里來(lái)

萬(wàn)事皆有出處,科學(xué)研究也一樣。

張文宏的博士論文要對(duì)付的是被稱為“白色瘟疫”的癆病,即肺結(jié)核。,順便科普一下,在我國(guó)傳染病疫情網(wǎng)絡(luò)報(bào)告中,肺結(jié)核發(fā)病和死亡數(shù)始終位居甲乙類傳染病之首。

一般的癆病有藥治,“異肼”之于癆病,就像“青蒿素”之于瘧疾。

但耐藥的癆病很難治,癆病的“青蒿素”一旦沒(méi)用了,就要上其他藥物(二線藥物),不僅貴還可能無(wú)效。

面對(duì)大量的耐藥結(jié)核病患者,臨床上希望有一種仿佛,一測(cè)就知道,哪些人身體攜帶里帶的結(jié)核桿菌變異了,致使治療癆病的“青蒿素”不管用了。

張文宏博士期間的研究就是希望把最常見(jiàn)的兩種變異(占臨床發(fā)現(xiàn)的70%)研究弄清楚,就好比研究新冠病毒的德?tīng)査儺愔旰屠愤_(dá)變異株,究竟該怎么治。

兩個(gè)突變都能導(dǎo)致耐藥嗎?回答了這個(gè)問(wèn)題,就能實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)治療,免得讓患者花冤枉錢(qián)。

2000年,人類基因組計(jì)劃剛剛完成草圖的繪制,那時(shí)候,測(cè)個(gè)基因組需要十幾年。

正是在這樣的分子生物學(xué)技術(shù)前提下,張文宏的研究利用了原始的質(zhì)粒構(gòu)建方法,讓突變基因表達(dá)出蛋白,并進(jìn)行了基因變化與耐藥與否的驗(yàn)證。

從臨床中發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,通過(guò)識(shí)別基因變異來(lái)推動(dòng)精準(zhǔn)治療的實(shí)現(xiàn),這樣的研究即便是在現(xiàn)在也不落伍。

(2)得出什么結(jié)論?到哪里去

那么,張文宏的博士論文究竟做出了什么結(jié)果呢?

結(jié)核桿菌(癆病的致病菌)具有極高的致病,過(guò)往研究的難點(diǎn)在于研究人員很可能被感染。直接從結(jié)核桿菌中提取蛋白質(zhì)研究非常緩慢。

所謂工欲善其事必先利其器。

張文宏通過(guò)基因工程的方法讓大腸桿菌中也能表達(dá)結(jié)核桿菌里的蛋白,給自己的研究以及其他研究者的研究提供足夠的材料。

經(jīng)過(guò)反復(fù)驗(yàn)證,張文宏的研究結(jié)果顯示了,結(jié)核桿菌關(guān)鍵基因?qū)е碌牡鞍鬃儺愔校?15個(gè)位置如果發(fā)生了突變,那么耐藥會(huì)發(fā)生,而如果第463個(gè)位置發(fā)生突變,很大可能不會(huì)導(dǎo)致耐藥發(fā)生。這與臨床的一些病例也相符合。

2000年,冷凍電鏡這樣高大上的科研重器離中國(guó)的普通科研工作者還很遠(yuǎn),人們看不到蛋白質(zhì)的構(gòu)象,只能通過(guò)迂回的方法去推論,哪些變異引發(fā)了蛋白質(zhì)功能的變化,最終給疾病和治療帶來(lái)哪些影響。

研究中,張文宏利用了“最早證實(shí)katG基因與異肼耐藥相關(guān)”的當(dāng)時(shí)的最時(shí)髦技術(shù)(堪比現(xiàn)在的基因編輯),即電轉(zhuǎn)化技術(shù)完成研究。

(3)究竟有沒(méi)有用?

張文宏的研究表明,結(jié)核桿菌中最常見(jiàn)的兩種變異,一種會(huì)導(dǎo)致耐藥,而另一種不會(huì),這項(xiàng)結(jié)果也解釋了過(guò)往的臨床病例中出現(xiàn)的奇怪現(xiàn)象。有了分子層面的結(jié)果,臨床上,結(jié)核病患者就可以通過(guò)突變位點(diǎn)的測(cè)序,分辨究竟有沒(méi)有耐藥,從而對(duì)癥下藥。

除了鑒定了一個(gè)有用的突變,張文宏的研究同時(shí)給出了方法和策略。

如何篩選對(duì)耐藥有價(jià)值的突變點(diǎn),并對(duì)初步的突變體實(shí)施篩選與評(píng)估策略。這樣的方法如果能夠普及,從基礎(chǔ)研究走向臨床,從臨床中發(fā)現(xiàn)突變點(diǎn),再做基礎(chǔ)研究驗(yàn)證,如此循環(huán)往復(fù),將對(duì)耐藥的分子機(jī)理更加明晰。

科學(xué)研究從臨床中來(lái),到臨床中去,張文宏后來(lái)身為感染科醫(yī)生一直在詮釋這樣的原則。

(4)高相似度的尷尬綜述部分

在張文宏的博士論文中,結(jié)構(gòu)清晰地介紹了3個(gè)部分的工作,每個(gè)部分中都有背景、研究方法、結(jié)果、討論等,其中也詳細(xì)介紹了包括參考文獻(xiàn)、試劑、菌株、序列等的來(lái)源。

那么,網(wǎng)上曝出的高相似度的部分出現(xiàn)在哪里呢?

經(jīng)過(guò)檢索,記者發(fā)現(xiàn)是在博士研究工作介紹結(jié)束之后的綜述部分。該部分相對(duì)獨(dú)立,是對(duì)當(dāng)前對(duì)于結(jié)核病耐藥研究的綜合介紹。從內(nèi)容而言,這一部分是對(duì)研究同行在同一領(lǐng)域的科研成果進(jìn)行梳理和整理,與張文宏在博士期間的研究不存在關(guān)聯(lián)。

這篇綜述的尷尬在于,它在整篇論文中處于可有可無(wú)的位置。前面對(duì)于博士期間的工作(包括研究背景和意義,這是論文綜述本來(lái)的作用),論文已經(jīng)做了詳細(xì)的展示和記錄。而在最后一部分為什么加入綜述,記者咨詢了幾位博士畢業(yè)的研究人員。

有研究人員表示,博士論文并不是都要發(fā)綜述,可有可無(wú);也有研究人員表示,(綜述)應(yīng)該放在前面,可能是有的學(xué)校模板要求不一樣……

一篇高質(zhì)量的博士研究論文,是否應(yīng)該被最后可有可無(wú)的綜述這一章影響,公眾在詳讀論文后應(yīng)該會(huì)有自己的判斷。

標(biāo)簽: 博士論文 結(jié)核桿菌 分子生物學(xué) 科技記者

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